在选择门店注册公司还是个体户时，需要根据以下因素进行综合考虑：

1. 法律责任不同：个体户是个人承担无限责任，而公司是股东承担有限责任。这意味着，个体户的债务风险由个人承担，而公司的债务风险由股东承担。因此，如果您有足够的资本并愿意承担相应的风险，可以选择注册公司。
2. 税收政策不同：个体户需要按照个人所得税法规定缴纳个人所得税，而公司需要缴纳企业所得税。此外，个体户可以享受一些税收优惠政策，如小微企业税收减免、增值税小规模纳税人税收减免等。因此，如果您想要享受税收优惠政策，可以选择个体户。
3. 注册流程不同：个体户的注册流程相对简单，而公司的注册流程相对复杂。个体户需要提供身份证、工商营业执照等相关证件，而公司需要提供公司名称、股东信息、资本金等相关信息。因此，如果您想要简化注册流程，可以选择个体户。
4. 经营规模不同：个体户的经营规模相对较小，而公司的经营规模相对较大。如果您想要扩大经营规模，可以考虑注册公司。

综上所述，选择门店注册公司还是个体户取决于您的具体情况和需求。如果您想要承担更大的法律责任并享受更多的税收优惠政策，可以选择注册公司。如果您想要简化注册流程并经营规模较小，可以选择个体户。无论您选择哪种方式，都需要遵守相关的法律法规和政策。